أمانة التخطيط والبحوث
تختص الأمانة بالدور التخطيطي والمساند لجميع الأمانات بالمجلس، وتعمل في عدة محاور محور التخطيط، محور الدراسات والبحوث، محور التقاريرالدولية، الاقليمية والوطنية . المهام والاختصاصات :
  الإشراف علي إعداد الخطط الاستراتيجية والسنوية للمجلس، وفقاً لخطط وإستراتيجيات الدولة.
  متابعة إعداد الخطة التنفيذية والإطار الزمني لتنفيذ الخطة.
  متابعة تنفيذ الخطط وإعداد تقارير الأداء ( شهرية، ربع سنوية، نصف سنوية والسنوية).
  اعداد الدراسات والبحوث ذات الصله بقضايا الطفولة.
  إعداد التقارير الدورية حول المواثيق والإتفاقياتالدولية والإقليمية التي وقع وصادق عليها السودان.
  إعداد التقارير الوطنية حول أوضاع الأطفال في السودان.